Ein Warenwirtschaftssystem ist ein EDV-unterstütztes Modell, das alle Warenströme in Geschäftsprozessen abbildet. Die Funktionsweise baut sich auf eine Datenbank auf, die alle Stamm- und Bewegungsdaten verwaltet. Mithilfe einer solchen Software können alle Bereiche des Betriebes ständig über aktuelle Daten verfügen. Ab einer gewissen Größenordnung kommt kein Unternehmen umhin, ein Warenwirtschaftssystem zu verwenden. Über die JTL-Wawi können beispielsweise alle Vertriebskanäle – egal wie viele Onlineshops betrieben werden – in Bezug auf Sortimentpflege, Lagerbestandsanpassung und Bestellabwicklung an einer einzigen Stelle verwaltet werden. Neben Rechnungen, Mahnungen und Gutschriften werden dort die Lieferantenbestellungen und Eingangsrechnungen erfasst. Preise und Lagerbestände der Angebote auf eBay, Amazon und in den eigenen Onlineshops werden automatisch angepasst, sobald ein Verkauf über einen dieser Vertriebskanäle stattfindet. Kunden können sich so voll auf die Bestellabwicklung und Warenbeschaffung konzentrieren und nicht auf die Lagerbestandsanpassung.